Nature：肠道微生物代谢游离新功能，促进HDAC3酶活性

哺乳动物巨噬细胞内和对其有益的共生有机物的协力进化导致了巨噬细胞内-有机物关连的发展。一般说来遗传粘贴使得哺乳动物巨噬细胞并能紧密结合外界状况信号，促使巨噬细胞对状况的适应性。但是仍然以来共生的消化道有机物来源不明的多种信号通路和多种状况信号是如何测量仪器基因表达的还不足见清楚。

消化道增生位于有机物群和巨噬细胞内彼此间的界面，促使关键外围的形成，在生活品质时期和伤害时期对消化道表皮同步进行补充。维持消化道增生分化成处理过程当中有多种一般说来遗传机制参加其当中，其当中HDACs的表达出来对于消化道稳态非常关键。消化道有机物来源不明的短链脂肪酸苯甲酸水（Butyrate）在体外减缓HDAC活性，苯甲酸水解决问题后的消化道组织增生当中HDAC活性下降。在乳胶狸当中植入产苯甲酸水的消化道有机物都会减缓消化道增生当中HDAC的活性。这些结果都所述消化道有机物来源不明的苯甲酸水减缓HDAC的活性。但是消化道有机物与组肽扶与此相反赖氨酸彼此间的基因表达机制是怎样的还不得而知。

近日，美国圣路易斯医院医疗当中心Theresa Alenghat研究组在Nature时代周刊上发表文章 Microbiota-derived metabolite promotes HDAC3 activity in the gut，推断出消化道有机物来源不明的激酶氨水并能调节消化道内组肽扶与此相反酶HDAC3的活性从而促使消化道增生的复建，揭开了巨噬细胞内对于消化道有机物信号响应的具体机制。

为了揭开消化道有机物派生降解有机体与一般说来遗传信号彼此间的关连，所写们对野生型以及消化道增生HDAC3敲除小狸当中的HDAC活性进性检查，推断出野生型准确率小狸当中的HDAC3表达出来正常并且较强稳固的赖氨酸，但是消化道增生HDAC3敲除小狸则相反。所写们打算知道HDAC3是否都会特异性调节消化道有机物敏感的信号正向。所写们推断出HDAC1与HDAC2在消化道增生当中也有表达出来，但并不能补偿金消化道增生当中HDAC3表达出来的缺失。而且在对乳胶狸和消化道增生HDAC3敲除小狸当中的消化道增生施用HDAC广谱减缓剂解决问题后，推断出在HDAC3敲除后其他繁多的HDACs仍然较强活性。这些结果所述消化道有机物促使增生当中HDAC3在正常消化道稳态当中的赖氨酸。

为了破译消化道有机物转录HDAC3的具体机制，所写们对乳胶狸和正常培养的小狸当中消化道增生当中的转录谱同步进行解析。所写们推断出在消化道有机物存在的增生当中与激酶氨降解相关的基因被广泛正向表达出来。可知的研究推断出激酶三氨（Inositol trisphosphate）都会通过强化HDAC3与转录肽的相互作用来增加HDAC3的活性。所写们推断出外加激酶三氨的确都会特异性增加HDAC3-NcoR重新分配肽的活性，NcoR肽对于HDAC3的扶与此相反赖氨酸非常关键。

进一步地，所写们打算知道乳胶狸与准确率的小狸消化道彼此间激酶三氨低水平是否存在关联性。所写们推断出准确率小狸当中无论是肠腔还是消化道增生当中激酶三氨的低水平都许多现代高于乳胶狸，所述消化道有机物的存在促使激酶三氨低水平的增加。为了评估激酶三氨对于消化道增生当中HDAC3活性的不良影响，所写们对消化道增生当中的HDAC3肽同步进行浓缩并与激酶三氨同步进行协力幼体，推断出激酶三氨的确并能增加内源HDAC3的活性。而且苯甲酸酮造成的HDAC3活性的减缓也可以被激酶三氨所拮抗。另外，所写们还推断出共生的消化道有机物都会通过激酶六氨（Phytate）降解唯一可促使消化道增生当中的HDAC3的机制。与激酶三氨相似，激酶六氨也都会正向消化道增生当中的HDAC3的活性。

为了检查消化道有机物激酶六氨依赖的降解对于HDAC活性的不良影响，所写们对定植野生型以及激酶六氨酶缺失型细菌的小狸同步进行分析。所写们推断出定植激酶六氨酶正常表达出来细菌的小狸相比于乳胶狸以及激酶六氨缺失型细菌小狸的激酶三氨低水平升高。对小狸同步进行右旋糖酐酮钠（Dextran sodium sulfate， DSS）解决问题后，都会正向小狸产生消化道疾病。为了检查激酶三氨在DSS解决问题正向的消化道疾病当中的作用，所写们对乳胶狸施用激酶三氨后推断出激酶三氨并能促使消化道从疾病当中恢复并增加乳胶狸的寿命。DSS正向的胃炎类似于病童当中溃疡性胃炎。为了进一步推定消化道有机物降解有机体的机制，所写们对人类紧密结合有机物组学计划（Integrative Human Microbiome Project）当中的生活品质抽取以及溃疡性胃炎患者的样品同步进行检查，推断出在溃疡性胃炎病童消化道当中激酶六氨酶的同位素远低于生活品质抽取之当中，所述激酶六氨对于消化道伤害复建是才会的。

总的来说，Alenghat研究组的工作推断出相比于乳胶狸，消化道有机物存在的小狸当中HDAC3活性许多现代大幅提高，这一大幅提高是通过共生的消化道有机物比如细菌激酶六氨以及激酶三氨的降解形成的。另外，激酶三氨都会正向病童来源不明的消化道类器官的生长、刺激HDAC3依赖的巨噬细胞增殖以及拮抗苯甲酸酮导致的消化道生长减缓，都会促使消化道疾病当中增生的复建。因此，所写们鉴定推断出了HDAC3作为巨噬细胞内响应多种消化道有机物信号的汇聚一般说来双生子的重要机制，揭开了消化道有机物、一般说来双生子以及有机物降解有机体在消化道表皮以及消化道疾病当中的重要基因表达和复建作用。

更早出处：

Shu-En Wu, Seika Hashimoto-Hill, Vivienne Woo, et al.Microbiota-derived metabolite promotes HDAC3 activity in the gut.Nature. 2020 Jul 30. doi: 10.1038/s41586-020-2604-2.